扩大海上风电开发在全球各地引发了激烈的争论。虽然政府和政策制定者将海上风电视为向可再生能源过渡的核心支柱，但许多沿海地区的居民却强烈反对这项技术。
反对海上风电基于多种因素，其中最主要的是项目对环境造成的破坏。反对者认为，鲸鱼死亡、鸟类迁徙模式受到扰乱以及其他一系列生态后果都是由于海上风电造成。
关于海上风电开发对生态的影响还有很多方面需要研究，但以下是经研究证实的海上风电开发对生态的三种影响。
1、水下噪音水平
工程师们开发了各种技术将风机固定在海床上，但最常见的是打桩，这会在周围的水生环境中产生危险的高噪音水平。重要的是，声音在水中的传播速度比在空气中快，从而显得更响亮。
风机打桩过程中发出的巨大声响可能会对施工区域的海洋哺乳动物造成无法弥补的听力损伤。研究认为，大型鲸鱼对打桩过程中产生的低频声音特别敏感。
不过，一旦海上风机投入运行，水下声级就不太可能达到海洋野生动物担心的水平。
此外，与需要打桩的固桩式海上风机相比，人们对漂浮市风机的兴趣日益浓厚。如果浮式海上风机技术成为行业标准，那么风机施工期间产生的水下噪音水平将大大降低。
2、鸟类碰撞
运行中的海上风电场还可能对海洋鸟类造成有害影响。鸟类很容易与风机叶片相撞，而绕过风电场会使在附近繁殖或觅食的鸟类付出额外的热量代价。迁徙模式也可能受到影响。
最近，科学界提出了一种巧妙的解决方案来解决风机与鸟类的碰撞问题。根据发表在《生物保护》（Biological Conservation）上的一项研究，有选择性地停止发生鸟类死亡率最高的风机可使鸟类死亡率降低50%。而且，气象雷达捕获的独特数据特征可能是了解何时开启和关闭风机的关键，从而在最大限度地提高能源生产的同时，最大限度地减少对鸟类的干扰。
3、电磁场
海上风电场产生的能源通常通过水下电缆传输回岸上。这些电缆发出的电磁场已被证实会对各种水生物种造成不利影响，如板鳃类鱼、硬骨鱼、十足目甲壳类动物以及海龟。
不过，相关研究提出了一些减轻这些影响的有效方法。首先，不在海龟筑巢的地方或已知会受到电磁场不利影响的物种密集区域铺设电缆线是一种可行的缓解技术。其他缓解技术包括将电缆埋得足够深，以尽量减少对海床的影响。如果由于海床地形限制而无法选择埋设电缆，那么用岩石或混凝土床垫覆盖电缆也是另一种选择。同样，电缆设计（例如，将电缆尽可能集中并使用金属护套）和电缆电压（在输送相同功率的情况下，高电压电缆系统产生的磁场低于低电压系统）也很重要。
在诸多“危险”之中，除了增加清洁能源生产这一明显好处之外，海上风电开发还可能带来生态效益。
一项研究的作者指出：“海上风机基础可以充当人工礁石，为动物提供附着的表面。因此，贝类和以贝类为食的动物（包括鱼类和海洋哺乳动物）的数量可能会增加。”
此外，科学家还推测，海上风电场可能会对海洋生态系统产生“庇护”作用，使大片海域无法进行航运和捕鱼活动。其他研究表明，海上风电场可能有机会与水产养殖项目相结合。
目前，全球有数以百计的海上风电场在生产能源，其中中国、英国和德国的海上风电场数量最多。预计未来十年还会有更多海上风电场上线。
在不可避免地面临许多物理和生态问题时，工程和建造界或许会开发创造性解决方案，这将会影响新兴海上风电行业的命运。
